Sua infraestrutura inclui um cais de aproximadamente 1.000 metros de extensão e quatro berços de atracação, além de terminais especializados para operações com propano, carvão, combustíveis, cruzeiros, contêineres (APM), grãos e açúcar.

Por sua vez, Puerto San José conta com três terminais MBM destinados à operação de combustíveis e melaço.

O rebocador SAAM Itza iniciou suas operações em Puerto Quetzal em 2019. Com 23 metros de comprimento e bollard pull superior a 60 toneladas, foi construído pela Med Marine em Ereğli, Turquia.

Seu nome, Itza, significa “Deusa da Água” ou “Feiticeira da Água” no idioma kaqchikel.